重案组探长文方（黎明 饰）自两月前妻子遇害后，脾气变得暴躁古怪，因对犯人动粗经常被人投诉。一桩妓女被杀案的调查过程中，文方认识了总区重案的高级督察纪少群（任贤齐 饰），并派手下帮他找回了被偷走的手机。妓女被杀案调查与一宗枪火案交织在一起，重案组和调查枪火案的分队联合行动，不料伏击行动遭泄露，双方在茶楼展开激战，文方手下兄弟身受重伤，纪警官也随后赶到，在协助追赶嫌犯途中被嫌犯开枪击中。妓女被杀案嫌犯初步锁定重案组探员高祥安（廖启志 饰），文方因包庇手下被停职。在众多兄弟的协助下，重案组抓到高祥安口中的戴渔帽的嫌犯，嫌犯对杀人案供认不讳。在压送嫌犯过程中嫌犯打个手铐并打伤祥安逃脱，接二两三的事故让文方对警界内部人员产生怀疑，在探员小美（叶璇 饰）的协助下，文方终于找出隐匿于警界之中的“老鬼”……
某小岛上，刘氏企业董事长刘长荣被人追杀坠崖。其私生子林光南警官去公司调查，恰逢刘家小姐安妮悲痛欲绝。当林光南透露出刘长荣的得力助手关武获救时，机要秘书叶洋有点失色。 某夜总会，刘氏少爷刘天云遇到杀手袭击，多亏林光南及时赶来。天云因与父亲不和，已离家两年，得知恶讯，他决定回家保护妹妹，追查杀父仇人。次日，刘氏兄妹祭奠父亲时再次遇袭。天云决心迅速查清，于是与林光南同去医院找关武。不想关武已被杀害，杀手被林光南自卫杀死。据回忆，他们分析这事可能与贩毒有关。天云正式入主公司，而叶洋不再上班。原来叶洋与郑三爷勾结贩毒，因刘长荣阻止便合伙杀了他。如今，他们对扫毒组组长林光南有所顾忌。天云发现仓库中有毒品。叶洋强行取货。当与三爷交易时，却发现“货”却成了面粉，为了向三爷交代，叶洋另外高价买来毒品，被警察围住，叶洋侥幸逃脱，只抓住他的一个手下。经审问，林光南得知“货”被刘氏调包之事，便找到天云，天云佯装不知。林光南又对三爷提出警告。大规模的扫毒行动展开。天云的公司也大有起色，并且天云与张协理产生感情。 刘长荣出现在香港。原来他被自己曾经施过恩的罗吉所救。罗吉奉命去广州捉拿叶洋，他得到一同受过训的艾伦警官的帮助。由于“货”吃紧，郑三爷便与天云联系，想取回叶洋那批“货”，结果接洽时起了纷争，天云身受重伤，被林光南所救，带回林家。当夜，安妮被绑架。在艾伦的帮助下，罗吉抓到了叶洋，使刘长荣得以洗清，于是刘长荣通知两个儿子来见他。他为天云的成绩感到欣慰，天云在管理中了解到父亲的伟大，两人和解。大家合谋，由天云约出郑三爷，林光南调动警方力量，罗吉帮忙。郑三爷父子一死一伤，安妮最终也安全得救。
自从阿乐（任达华饰）当上和联胜办事人后，总算有一个过度性的安宁局面。然而，两年一度的办事人选举又一次即将来临。 现任办事人阿乐，希望说服一众元老和邓伯（王天林饰）。而人马众多的Jimmy仔（古天乐饰）为被看好的新办事人人选，但他却只想着生意。一次交易，Jimmy在国内被捕，对方告诫他不可从事生意活动，除非身为办事人。为了大计，Jimmy终与阿乐反目，争当办事人。 另一边，阿乐为了铲除障碍，说服东莞仔（林家栋饰）与其联手，绑架Jimmy幕后老板以迫其放弃。一场腥风血雨的冲突拉开序幕，最后他们的恩怨如何解决？是否真能以和为贵？
美国唐人街由于越南难民的涌入，形势更加复杂。当局对此更为关注和恐惧，遂暗中策划以华制华政策。一日，的士司机关志华突遭越青帮袭击，关与同伙准备报仇。当他们赶至越青帮聚集地时，发现对方全已遭毒手。警方接报后将此地包围，关被当成凶手为警方通缉，他只好潜返香港暂避。美警方追至香港，关再陷杀机之中。关从律师口中得知此乃政治阴谋。由于关的机智勇猛，越青帮没能奈何他，却捉走他的妻儿作人质迫他投降。关在澳门与越青帮交换人质时爆发了一场血战，他虽救出了妻儿，但料到今后的日子仍将陷于荆棘之中。